В 1968–1974 годы он работал режиссером на студии «Таллиннфильм». В 1974–1986 годах был главным режиссером Молодежного театра и в 1989–1991 — Вильяндиского театра «Угала», а в 1986–1988 и 1991–2000 годах — режиссером-постановщиком театра «Угала».

В 1986–1995 годы руководил Высшей школой сценического искусства в Музыкальной академии Эстонии.

С 2002 года Калью Комиссаров руководил отделением сценического искусства Вильяндиского колледжа культуры. До того работал преподавателем отделения и заведующим кафедрой театрального искусства.

В 2006 году Комиссаров был награждан Орденом «Белая звезда» третьей степени.